La estructura organizacional del GRUFIDES es el siguiente:

a) Asamblea General.
b) Consejo Directivo.

La Asamblea General está compuesta por :

a) Los miembros fundadores y
b) Los miembros asociados.

El Consejo Directivo está conformado por:

a) Director (a) Ejecutivo (a) .
b) Secretario (a) Ejecutivo (a).
c) Tesorero (a).
d) Coordinadores (as) de Áreas.

(Area 1) Formación de Recursos Humanos para el Desarrollo.
(Area 2) Conservación y Desarrollo Ambiental.
(Area 3) Articulación Universidad Sociedad.
(Area 4) Equidad de Género.